Il s’est rendu en Chine et a succédé à la branche Huanglong (Ōryu) du zen rinzai, qu’il a introduite au Japon. Il a fondé le temple Kenninji à Kyoto, où Dogen. pratiquait avant et juste après son départ pour la Chine. Dōgen, qui, en tant que jeune moine, a peut-être rencontré Eisai, parla plus tard de lui avec beaucoup de respect. Son nom posthume de l’empereur était Senkō (« Milles Lumières »).